MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 13187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	AGC	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019703	GCT	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019703	TGC	2	6	1480	1485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019703	TCA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019703	ATTT	2	8	1652	1659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019703	CTA	3	9	1881	1889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019703	TTTAAA	2	12	1893	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019703	AGT	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019703	TCCGA	2	10	2009	2018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019703	AGC	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019703	A	6	6	2036	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019703	CGAT	2	8	2052	2059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019703	A	6	6	2107	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019703	AAGC	2	8	2134	2141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019703	A	6	6	2149	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019703	AAGC	2	8	2176	2183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019703	A	6	6	2191	2196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019703	TCCGA	2	10	2220	2229	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019703	ATCCG	2	10	2231	2240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019703	AGC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019703	A	8	8	2259	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019703	A	8	8	2306	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019703	T	6	6	2477	2482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019703	GTTT	2	8	2512	2519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019703	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019703	A	6	6	2524	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019703	T	7	7	2603	2609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019703	GTT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019703	GAA	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019703	T	6	6	2658	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019703	GCA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019703	AGC	2	6	2853	2858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019703	A	7	7	2922	2928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019703	CTT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019703	GC	3	6	3373	3378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019703	AAG	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019703	CTG	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019703	GA	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019703	TGC	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019703	AGC	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019703	GAG	2	6	5349	5354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019703	ATG	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019703	TC	3	6	6956	6961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019703	CAG	2	6	6979	6984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019703	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019703	GTA	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019703	TTCA	2	8	7045	7052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019703	TCC	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019703	ATG	2	6	9496	9501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019703	TTGA	2	8	9502	9509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019703	TTG	3	9	9739	9747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019703	T	7	7	10255	10261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019703	CGC	2	6	10315	10320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019703	GAT	2	6	11230	11235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019703	AGC	2	6	11302	11307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019703	TCA	2	6	13177	13182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019703	CAAT	2	8	13187	13194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019703	ACG	2	6	13237	13242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019703	TCA	2	6	13280	13285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019703	TGA	2	6	13308	13313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019703	CCG	2	6	13405	13410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019703	ATCA	2	8	13465	13472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019703	TTA	2	6	13533	13538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019703	AAT	2	6	13539	13544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019703	AAT	2	6	13562	13567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019703	A	6	6	13574	13579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019703	AAAG	2	8	13597	13604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019703	TCCT	2	8	13613	13620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019703	AGA	2	6	13626	13631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019703	CAA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019703	TTTG	2	8	14131	14138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019703	AG	3	6	14438	14443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019703	AGCA	2	8	14449	14456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019703	CAG	2	6	14510	14515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019703	ACC	2	6	14520	14525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019703	G	6	6	14537	14542	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019703	GCGAG	2	10	14584	14593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019703	TTCAG	2	10	14608	14617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019703	CAG	2	6	15196	15201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019703	GCG	2	6	15879	15884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019703	TGG	2	6	15923	15928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019703	AAT	2	6	16089	16094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019703	AGA	2	6	20041	20046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019703	ATG	2	6	22320	22325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019703	GACT	2	8	22350	22357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019703	C	6	6	22365	22370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_019703	GAG	2	6	22878	22883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019703	A	6	6	22886	22891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019703	GCG	2	6	22903	22908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019703	CCAC	2	8	22930	22937	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_019703	AGA	2	6	22959	22964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019703	GCT	2	6	23396	23401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019703	CGG	2	6	23431	23436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019703	T	6	6	23439	23444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019703	AGA	2	6	23478	23483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019703	CGC	2	6	23494	23499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019703	A	6	6	23507	23512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019703	A	6	6	23574	23579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019703	CTA	2	6	23605	23610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019703	TGCT	2	8	24374	24381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019703	GCG	2	6	24785	24790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019703	CGC	2	6	24819	24824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019703	GGA	2	6	25757	25762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019703	GCT	2	6	25864	25869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019703	A	6	6	25874	25879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019703	ACCT	2	8	27303	27310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019703	ACA	2	6	27332	27337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019703	CAC	2	6	27353	27358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019703	A	6	6	27469	27474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019703	ATT	2	6	27522	27527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019703	TGG	2	6	27624	27629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019703	TAC	2	6	27634	27639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019703	CTG	2	6	27673	27678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019703	AGG	2	6	27710	27715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019703	GGC	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019703	A	8	8	28715	28722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019703	TTC	2	6	28773	28778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019703	TGC	2	6	28892	28897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019703	TCC	2	6	28900	28905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019703	CA	3	6	29766	29771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019703	CGC	2	6	30620	30625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019703	CAAA	2	8	32204	32211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019703	GTT	2	6	32250	32255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019703	A	6	6	32264	32269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019703	A	6	6	32336	32341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019703	T	6	6	32355	32360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019703	TTC	2	6	32369	32374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019703	CTGT	2	8	32379	32386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019703	TCC	2	6	32390	32395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019703	GCCC	2	8	34696	34703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_019703	ACC	2	6	35495	35500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019703	TAT	2	6	36955	36960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019703	GA	3	6	36969	36974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019703	GT	3	6	36980	36985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019703	CTT	2	6	37037	37042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019703	GC	3	6	37062	37067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019703	GAGCA	2	10	37072	37081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019703	GCT	2	6	37089	37094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019703	GAC	2	6	40025	40030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019703	CCCGA	2	10	41768	41777	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_019703	A	6	6	41777	41782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019703	GCC	2	6	41840	41845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019703	CTGGT	2	10	42969	42978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019703	CG	3	6	43023	43028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019703	CAC	2	6	43041	43046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019703	AAAT	2	8	43080	43087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019703	ATGA	2	8	43125	43132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019703	GA	3	6	43156	43161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_019703	CAA	2	6	43740	43745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_019703	GCGATC	2	12	81096	81107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_019703	AAT	2	6	81144	81149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_019703	TCC	2	6	81385	81390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_019703	CGAT	2	8	81393	81400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
293	NC_019703	CAA	2	6	83405	83410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_019703	CTA	2	6	83475	83480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_019703	GTA	2	6	83481	83486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_019703	GTC	2	6	131221	131226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_019703	CCT	2	6	134705	134710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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481	NC_019703	A	7	7	150684	150690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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